转录组高通量测序应用

悬液制备好后质检结果的判断也是大家需要掌握的必备技能。单细胞悬液质检关卡究竟是怎样运作的呢？单细胞悬液质控要求：•细胞浓度：700-1200cells/µl；•细胞活率>80%（当细胞悬液活率低于70%时建议进行去除死细胞处理）；细胞团及碎片杂质

IlluminaHiSeq2500/4000可以运行PE150/PE250模式，可以承担转录组测序、人基因组重测序、外显子捕获测序、宏基因组测序、微生物分类测序等服务；IlluminaMiSeq运行PE300模式，可以承担细菌基因组重测序/Denovo测序、微生物分类测序、扩增子测序、核酸适配体测序等服务；LifeIontorrentPGM运行314、316、318芯片，可以承接扩增子测序、靶区域测序、基因组重测序服务；PacBioSequel/RSII该测序平台读长超长，平均可达10kb以上，主要承接细菌基因组完成图测序、***基因组精细图测序、全长转录本测序等服务；上海市微生物高通量测序应用关键是KBSeq还可以省钱。

高通量测序技术是可以平行对数百万甚至数十亿条序列测序的技术。在基因组测序、转录组测序、宏基因组测序、表观遗传测序、外显子捕获测序、靶区域测序等诸多科研及精细医疗检测领域内有普遍的运用。生工生物工程（上海）股份有限公司自2011年成立高通量测序部以来，逐步引进了Illumina，Life，PacBio等二代/三代测序平台。建立了2000m2高标准实验室（通过了国家ISO认证）以及10PB级运算能力的服务器集群，能满足绝大多数科研客户的研究需要。同时，生工高通量测序团队建设也在不断完善中，目前有50余专职员工，其中高级技术人员以及高级生物信息工程师占比50%以上，5年来，通过生工高通量测序结果发表的文章累计影响因子超过1000分以上。

什么是KBSeq全质粒测序？它基于第二代测序技术，一次性对大量质粒（比较多可达6000个样本）进行并行测序，利用生物信息学分析，对数据进行序列组装并获得每一个质粒的完整序列信息。所以我们也称它为，可以部分替代一代测序的高通量测序技术。测序长度：对于测序长度较长，如果我们用Sanger测序往往需要花费大量的时间，而我们KBSeq全质粒测序则只需要5-7天，就可以测通片段长度小于30kb以下的片段。样本用量：KBSeq全质粒测序对于样本的量，要求的也比较少，比如质粒我们的样本要求DNA的浓度需≥ 1 ng/μl, 体积需≥5 μl，如果比较珍贵的样本或者是样本比较难提取的，KBSeq就更为适合了。Illumina HiSeq2500/4000 可以运行PE150/PE250模式。

生工高通量测序样品要求，组织/细胞样品：请使用新鲜取样的实验材料，当场分成小块后立即用液氮或干冰乙醇速冻，保存于-80°C冰箱，用足量的干冰（根据经验，在秋冬季节，如果打包合适，3公斤块状干冰可以维持30-40小时）寄送;于微生物样品，请客户如实声明所属物种，对于可能致病的微生物，生工保留拒收的权利;对于需要进行RNA抽提的样品，可以但不建议将组织在液氮中研磨后用TRIzol悬浮后用普通冰袋寄送，具体情况请先取得沟通。如果问现在什么技术是测序届的宠儿，那么单细胞测序则是我们不得不提及的技术了。上海市微生物高通量测序应用

10xGenomics Chromium X多通道+高捕获+10x的CellPlex多样本混样技术。转录组高通量测序应用

台盼蓝染色原理：台盼蓝染色原理：台盼蓝不能透过活细胞正常完整的细胞膜，故活细胞不被染色。而死细胞的细胞膜透性增高，可使染料进入细胞内而使死细胞染成淡蓝色。

通过显微镜使用血球计数板质检得到质检结果：明场（细胞未染色）：主要可以观察悬液背景质量（背景干净，无杂质碎片，无细胞团块）；台盼蓝场（细胞与台盼蓝染色后）：主要可以观察活性（主要为活细胞，未染色蓝色的为活细胞）；通过台盼蓝场计算活率：90%>80%；细胞浓度:710cells/µl;等结果来看，血球计数板质检结果的展示可以看出所有指标均符合上机标准，属于高质量单细胞悬液。 转录组高通量测序应用

生工生物工程（上海）股份有限公司是一家有着雄厚实力背景、信誉可靠、励精图治、展望未来、有梦想有目标，有组织有体系的公司，坚持于带领员工在未来的道路上大放光明，携手共画蓝图，在上海市等地区的医药健康行业中积累了大批忠诚的客户粉丝源，也收获了良好的用户口碑，为公司的发展奠定的良好的行业基础，也希望未来公司能成为*****，努力为行业领域的发展奉献出自己的一份力量，我们相信精益求精的工作态度和不断的完善创新理念以及自强不息，斗志昂扬的的企业精神将**生工生物工程供应和您一起携手步入辉煌，共创佳绩，一直以来，公司贯彻执行科学管理、创新发展、诚实守信的方针，员工精诚努力，协同奋取，以品质、服务来赢得市场，我们一直在路上！